Les Centres Nationaux de Référence (CNR) sont des laboratoires experts dans la microbiologie des maladies infectieuses.

Ce sont des laboratoires localisés au sein d’établissements publics ou privés de santé, d’enseignement ou de recherche. Ils sont nommés pour 5 ans par le ministre chargé de la Santé sur proposition de l’InVS (article L 1413-4 du code de la santé publique). La reconduction des Centre Nationaux de Référence est soumise à une évaluation faite par un Comité des CNR placé sous la responsabilité du Directeur général de l'Institut de Veille Sanitaire (InVS). Leurs missions sont également définies par arrêté du Ministère en charge de la santé.

Le laboratoire de bactériologie du CHU de Lyon a été désigné CNR des Staphylocoques. Il est chargé, en liaison étroite avec l'Institut National de Veille Sanitaire (InVS), de contribuer au diagnostic et à la surveillance épidémiologique des infections humaines causées par les staphylocoques.

En fonction de leur type d'activité les CNR ont des missions :

 Plus particulièrement, le CNR des Staphylocoques  a pour mission :

Apporter une expertise microbiologique :

Contribuer à la surveillance épidémiologique des infections et toxémies staphylococciques en lien avec l’lnstitut de veille sanitaire :

Contribuer à l’alerte en signalant à l’lnstitut de veille sanitaire tout événement inhabituel :