Missions du CNR des Staphylocoques

Le CNR Staphylocoques s’engage à assurer les missions définies par le décret n° 2016-806 du 16 juin 2016 relatif aux centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles et par l’arrêté de mars 2022 fixant le cahier des charges des centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles.

Il sera en outre particulièrement demandé à ce CNR les missions suivantes :

Expertise

- en développant et en diffusant des techniques de typage moléculaire ;

- en développant et en maintenant une collection de souches responsables d’infections nosocomiales et communautaires ;

- en identifiant et en typant les souches responsables de formes cliniques inhabituelles et les souches multi-résistantes de diffusion clonale et caractériser leurs toxines ;

- en recherchant et en caractérisant les toxines dans les prélèvements cliniques et alimentaires, dans le cadre de l’investigation de toxi-infections alimentaires ou d’autres cas groupés ;

- en identifiant de nouveaux génotypes de résistance aux anti-infectieux et en caractérisant les mécanismes de résistance en collaboration avec le CNR Résistance aux antibiotiques ;

- en évaluant et en validant, en lien avec le CNR de la résistance aux antibiotiques, les techniques de détection de la résistance aux glycopeptides chez les staphylocoques, en assurant leur diffusion et en développant une procédure de contrôle de qualité ;

- du fait de la fréquence des souches résistantes à la méticilline (SARM) dans les établissements de santé en France, le CNR Staphylocoque entretiendra des relations privilégiées avec le CNR Résistance aux antibiotiques et sera membre du réseau constitué autour de ce dernier.

Conseil

Dans le cadre du plan gouvernemental NRBC de 2016, notamment dans sa spécificité Biotox, le CNR apportera son expertise spécifique aux instances concernées de santé publique et sécurité nationale. Il contribuera ainsi :

- en tant que membre d’appui et d’expertise analytique et technique du réseau national des laboratoires biotox, piratox et piratome (RNLB2P) ;

- en contribuant à la réponse analytique d’un événement « biotox » lors de l’activation du RNLB2P ;

- en contribuant à la réponse analytique d’un événement « biotox » lors de l’activation du RNLB2P ;

- en contribuant à l'élaboration d'une collection nationale de souches de référence ;

- en participant chaque année au séminaire du RNLB2P

Contribution à la surveillance épidémiologique, en lien avec l’agence nationale de santé publique

- en ciblant en priorité les infections et toxémies staphylococciques et les souches présentant une résistance particulière ;

- en renforçant les collaborations avec les réseaux des laboratoires hospitaliers de microbiologie, notamment pour les souches responsables d’infections nosocomiales ;

- en développant un partenariat avec des réseaux de laboratoires de biologie médicale pour la surveillance de l'émergence de clones responsables d’infections en ville ;

- en collaborant aux enquêtes épidémiologiques ;

- en participant à l’investigation des cas groupés d'infections staphylococciques ;

- en collaborant avec les réseaux de surveillance nationaux (PRIMO, SPARES), européens et internationaux.

Contribution à l’alerte

- en signalant à l’agence nationale de santé publique tout événement inhabituel : émergence d’un nouveau phénotype de résistance aux antibiotiques ; modification des formes cliniques (répartition, modification de leur expression clinique, formes inhabituelles), émergence de souches à la virulence particulière ; détection de cas groupés ; etc